Jan van der Linden trad in 2002 in dienst van het FPB. Als lid van de Equipe Structurele Studiën doet hij studies op het gebied van markthervorming en concurrentie, steeds in het kader van de structurele hervormingsprogramma’s van de EU en de vervolmaking van de interne markt. Zijn belangrijkste thema’s zijn hervorming van netwerkindustrieën, concurrentie in de detailhandel, marktregulering en de meting van de intensiteit van concurrentie. Daarnaast werkte hij onder andere mee aan studies over de Dienstenrichtlijn, de Belgisch-Nederlandse kandidatuur voor het WK voetbal en de prijsregulering in de Belgische rusthuizen. Hij droeg ook bij aan meerdere Cardiff-rapporten en Nationale Hervormingsprogramma’s. Jan van der Linden coördineert de redactie van de Short Term Update, de driemaandelijkse nieuwsbrief over de conjuncturele en structurele stand van de Belgische economie.